Resources: Tutorials

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  1. EMME basic: Experimental Metadata Management Environment through ISAtools

    07 Jun 2015 | Tutorials | Contributor(s): Cyril Monjeaud, yvan le bras

    Support utilisé lors de la formation EMME du 15 novembre 2013. Ce document présente l'utilisation des différents outils mis à disposition à travers le portail EMME, également accessible via la section e-Infrastructure/Data-centered World/Metadata management du HUB eBGO.

  2. EMME advanced: Experimental Metadata Management Environment through ISAtools, Pydio, Galaxy & BioInvIndex

    07 Jun 2015 | Tutorials | Contributor(s): Cyril Monjeaud, yvan le bras

    Support utilisé lors de la formation EMME du 15 novembre 2013. Ce document présente l'utilisation des différents outils mis à disposition à travers le portail EMME, également accessible via la section e-Infrastructure/Data-centered World/Metadata management du HUB eBGO. Ces outils sont : *la...

  3. Analyse de données RADseq sous Galaxy : l'exemple de STACKS

    07 Jun 2015 | Tutorials | Contributor(s): yvan le bras, Cyril Monjeaud, Anthony Bretaudeau

    Support de la formation RADseq sous Galaxy dispensée sur la plateforme bioinformatique rennaise GenOuest.Lien vers le formulaire d'inscription. PrésentationCette formation initie l'utilisation de Stacks dans l'environnement Galaxy.En se basant sur une plateforme web, comme c'est la cas avec...

  4. Formation Intégration d'outils dans la plateforme web GALAXY version 2014

    07 Jun 2015 | Tutorials | Contributor(s): Cyril Monjeaud, yvan le bras

    PresentationBiological data analysys requires more use of IT resources and environments often hard to understand for Biologists.This training session presents the use of Galaxy environment for programmersGoalsGalaxy tools integration principles. Understand Galaxy filesystem organization, write...

  5. Tutorial : RNAseq sous Galaxy, le cas du poulet

    07 Jun 2015 | Tutorials | Contributor(s): yvan le bras, Pierre-François Roux, Sandrine Lagarrigue

    Support utilisé lors de la formation RNAseq proposée par l'Agrocampus Ouest de Rennes. L'idée est de partir des données poulet générées et utilisées par Pierre François Roux et Sandrine Lagarrigue (Laboratoire de Génétique, UMR INRA Agrocampus Ouest PEGASE Rennes/St-Gilles) dans le cadre du...

  6. Tutorial : Premiers exercices sous Galaxy

    07 Jun 2015 | Tutorials | Contributor(s): yvan le bras, Cyril Monjeaud

    Support utilisé lors de premiers exercices d'entraînements sous Galaxy pour les formations

  7. Tutorial : Introduction aux NGS

    07 Jun 2015 | Tutorials | Contributor(s): yvan le bras, Cyril Monjeaud

    Document utilisé lors des formations pour introduire les NGS

  8. Tutorial : Initiation à la plateforme web Galaxy

    07 Jun 2015 | Tutorials | Contributor(s): yvan le bras, Cyril Monjeaud

    Support de formation présentant la plateforme web d'analyse de données NGS Galaxy

  9. Linux/Unix: A short introduction

    07 Jun 2015 | Tutorials | Contributor(s): yvan le bras

    A very short introduction to Unix/Linux

  10. Formation Intégration d'outils dans la plateforme web GALAXY version 2015

    08 Jun 2015 | Tutorials | Contributor(s): Cyril Monjeaud, yvan le bras

    PresentationBiological data analysys requires more use of IT resources and environments often hard to understand for Biologists.This training session presents the use of Galaxy environment for programmersGoalsGalaxy tools integration principles. Understand Galaxy filesystem organization, write...